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胡家志
邮  箱: hujz(AT)pku.edu.cn
职  称:
研究员
实验室电话: 62744611
实验室地址: 北京市海淀区颐和园路5号,北京大学,金光生命科学大楼,100871
个人简历
教育经历
2006.9-2012.7    博士    北京大学生命科学学院
2002.9-2006.7    学士    北京大学生命科学学院
工作经历
2016.10至今    研究员    北京大学生命科学学院
2012.9-2016.9    博士后    哈佛大学医学院及波士顿儿童医院
荣誉奖励
哈佛华人生命科学研究奖,2016
美国癌症研究中心博士后奖学金,2014
吴瑞奖学金,2012
北京市优秀毕业生,2012
北京大学优秀毕业生,2012
北京大学优秀毕业论文奖,2012
书籍编撰
Frock RL#, Hu J#, & Alt FW. (2015). Mechanisms of recurrent chromosomal translocations. In book: Chromosomal Translocations and Genome Rearrangements in Cancer. Springer International Publishing, ISBN: 978-3-319-19983-2. doi: 10.1007/978-3-319-19983-2
科研领域描述
淋巴细胞免疫受体(包括抗体和T细胞受体)的产生依赖于RAG内切酶起始的V(D)J重排过程。在V(D)J重排过程中,RAG会主动切开DNA双链,而这些DNA双链断裂的修复依赖于体内的DNA修复途径。一旦这些DNA损伤不能正确修复,则可能形成染色体易位,从而高调癌症基因,如C-MYC等,进而导致淋巴瘤等癌症的发生。为了研究淋巴细胞内RAG介导的程序性损伤的调控机制及其相关的肿瘤发生机理,我们开发了基于二代高通量测序的染色体易位/DNA双链断裂测序方法,计划用该方法来高灵敏度地追踪DNA双链断裂在细胞内的发生、修复过程并研究其促癌机理。此外,我们计划利用基于单细胞测序的DNA复制和细胞转录测序技术以研究DNA复制和细胞转录与淋巴细胞基因组稳定性的关系,并进一步阐明基因组三维结构在RAG活性、DNA复制和细胞转录方面的关键调控机制。V(D)J重排的相关研究有助于了解免疫受体的发育和特异性产生的分子机制,我们开发了可定量的免疫组化库测序新技术并计划利用该方法深入研究淋巴细胞免疫受体发育机制以及实现针对特定抗原的特异性免疫受体的筛选和应用。
代表性论文
代表性科研论文: (# co-first authors, *co-corresponding authors)
1. Lin SG#, Ba Z#, Du Z#, Zhang Y, Hu J* & Alt FW*. (2016). A highly sensitive and unbiased approach for elucidating antibody repertoires. Proc Natl Acad Sci USA 113(28):7846-51. doi:10.1073/pnas.1608649113.

2.Hu J#, Meyers RM#, Dong J, Panchakshari RA, Alt FW* & Frock RL*. (2015). Detecting DNA double-stranded breaks in mammalian genomes by linear amplification-mediated high-throughput genome-wide translocation sequencing. Nature Protocols 11(5): 853-71. doi: 10.1038/nprot.2016.043.

3.Hu J#, Zhang Y#, Zhao L, Frock RL, Du Z, Meyers RM, Meng F-L, Schatz DG, & Alt FW. (2015). Chromosomal loop domains direct the recombination of antigen receptor genes. Cell 163(4): 947-59. doi: 10.1016/j.cell.2015.10. 016.

4.Frock RL#, Hu J#, Meyers RM, Ho Y-J, Kii E, & Alt FW. (2015). Genome-wide detection of DNA double-stranded breaks induced by engineered nucleases. Nature Biotechnology 33(2):179-86. doi: 10.1038/nbt.3101.

5.Hu J#, Tepsuporn S#, Meyers RM, Gostissa M*, & Alt FW*. (2014). Developmental propagation of V(D)J recombination-associated DNA breaks and translocations in mature B cells via dicentric chromosomes. Proc Natl Acad Sci USA 111(28): 10269-74. doi: 10.1073/pnas.1410112111.

6.Tepsuporn S#, Hu J#, Gostissa M*, & Alt FW*. (2014). Mechanisms that can promote peripheral B-cell lymphoma in ATM-deficient mice. Cancer Immunol. Res. 2(9): 857-66. doi: 10.1158/2326-6066. CIR-14-0090.

7.Hu J, Sun L, Shen F, Chen Y, Hua Y, Liu Y, Zhang M, Hu Y, Wang Q, Xu W, Sun F, Ji J, Murray JM, Carr AM, & Kong D. (2012). The intra-S phase checkpoint pathway targets Dna2 to prevent stalled replication forks from reversing. Cell 149(6): 1221-32. doi: 10.1016/j.cell.2012.04.030.

其它科研论文(# co-first authors, *co-corresponding authors)
1.Guan L, He P, Yang F, Zhang Y, Hu Y, Ding J, Hua Y, Zhang Y, Ye Q, Hu J, Wang T, Jin C, Kong D. (2017). Sap1 is a replication initiation factor essential for the assembly of pre-replicative complex in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe. J Biol Chem. 2017 Feb 21. pii: jbc.M116.767806. doi: 10.1074/jbc.M116.767806.

2.Liu B, Hu J, Wang J, Kong D. (2017). Direct visualization of RNA-DNA primer removal from Okazaki Fragments provides support for flap cleavage and exonucleolytic pathways in eukaryotic cells. J Biol Chem. 2017 Feb 3. pii: jbc.M116.758599. doi: 10.1074/jbc.M116.758599.

3.Zhao L#, Frock RL#, Du Z, Hu J, Cheng L, Krangel MS*, Alt FW*. (2016). Orientation-specific RAG activity in chromosomal loop domains contributes to Tcr V(D)J recombination during T cell development. J Exp Med 213(9): 1921-36. doi: 10.1084/jem.20160670.

4.Dong J#, Panchakshari RA#, Zhang T#, Zhang Y, Hu J, Volpi SA, Meyers RM, Ho Y-J, Du Z, Robbiani DF, Meng F-L, Gostissa M, Nussenzweig MC, Manis JP*, & Alt FW*. (2015). Orientation-specific joining of AID-initiated DNA breaks promotes antibody class switching. Nature 525(7567): 134-9. doi: 10.1038 /nature14970.

5.Meng F-L#, Du Z#, Federation A#, Hu J, Wang Q, Kieffer-Kwon KR, Meyers RM, Amor C, Wasserman CR, Neuberg D, Casellas R, Nussenzweig MC, Bradner JE*, Liu XS, & Alt FW*. (2014). Convergent transcription at intragenic Super-Enhancers targets AID-initiated genomic instability. Cell 159(7): 1538-48. doi: 10.1016/j.cell. 2014.11.014.
执教课程
《免疫学》
实验室简介
免疫学与癌症基因组学
实验室成员: 2015级-刘孟竺
2016级-甘婷婷、尹健行、张微微

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现对外招收具有免疫学或生物信息学背景的博士后,欢迎申请!
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