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伊成器

邮  箱: chengqi.yi@pku.edu.cn

职  称:教授

办公室电话:62752895

办公室地址:北京市海淀区颐和园路5号,北京大学,金光生命科学大楼,100871

实验室电话:62752895

实验室地址:北京市海淀区颐和园路5号,北京大学,金光生命科学大楼,100871

实验室主页:http://www.yi-lab.org

  • 个人简介
  • 科研领域
  • 代表性论文
  • 实验室简介

教育经历:

2005 – 2010, 理学博士,芝加哥大学化学系
2001 – 2005, 理学学士,中国科学技术大学化学系


荣誉奖励:

中组部万人计划领军人才,2019
国家自然科学基金委杰出青年科学基金项目,2018
科技部中青年科技创新领军人才,2018
OKeanos-CAPA Young Investigator Award,2018
Bayer Investigator Award at PKU,2018
中国化学会化学生物学奖突出贡献奖(35周岁以下),2018
第十六届霍英东青年教师基金,2018
第十届“药明康德生命化学研究奖”学者奖,2016
中国化学会青年化学奖,2016
国家自然科学基金委优秀青年科学基金项目,2015
IUPAC Prize for Young Chemists, 2011

工作经历:

2019- 至今,正教授,北京大学生命科学学院
2014 - 至今,研究员(双聘),北京大学化学与分子工程学院
2013 - 至今,研究员,北京大学合成与功能生物分子中心
2012 - 至今,研究员,北大清华生命联合中心
2017 - 2018,长聘副教授,北京大学生命科学学院
2012 - 2017,助理教授,北京大学生命科学学院
2010 – 2011,博士后,芝加哥大学生物化学与分子生物学系

学术任职:

2017 - present, the Chinese Cell Biology Society
2013 – present, the RNA society
2013 – present, the Chinese Society of Biochemistry and Molecular Biology
2012 – present, the Chinese Crystallographic Society
2012 – present, the Chinese Chemical Society
        
    实验室致力于RNA/DNA修饰的生物学通路、功能和机制研究。为了实现这一目标,我们综合运用包括化学生物学、表观遗传学、基因编辑、单细胞组学和基因组学等多学科手段,旨在揭示核酸表观遗传修饰的新颖功能和调控机制。
1. RNA修饰和表观转录组学
    几十年的研究已经鉴定了100多种转录后修饰。研究人员之前认为,一旦RNA修饰产生,这些共价修饰都是稳定存在、不可逆转的。然而,最近关于6-甲基腺嘌呤(m6A)的一系列研究证明,RNA甲基化也是动态可逆的,并且在基因表达调控中起到重要作用。因此,“表观转录组学”也随之兴起。
除了m6A,转录组上还存在其它表观遗传修饰。我们课题组最近的研究发现,多种之前认为只在非编码RNA上存在的转录后修饰,即假尿嘧啶(Ψ)和1-甲基腺嘌呤(m1A),也广泛存在于哺乳动物的mRNA当中。我们的研究表明这些转录后修饰在转录组中广泛存在,受多种外界刺激的动态调控,并且对于m1A来说,可以被潜在的“eraser”消码器蛋白去甲基化。然而,mRNA上m1A和Ψ修饰的生物学功能还尚不清楚。此外,我们最近鉴定了mRNA上的动态、可逆修饰m6Am。我们希望利用课题组已经开发的新颖表观转录组测序技术,来阐释这些RNA修饰在生理及病理条件下的功能和调控机制,从而在表观转录组学这个新兴起的学科中发现一片“新大陆”。

2. 基因编辑
    基因编辑作为新兴的颠覆式生物技术,已经在生物医药、农业、能源和生物安全等方面展现了巨大的潜力。基于我们在化学生物学、分子生物学和高通量测序等方面的特长,本课题组也评价现有的基因编辑工具,并发展更为精准、强大、便捷的基因编辑新技术。

3. DNA修饰和表观基因组学
    哺乳动物基因组中,具有5-甲基胞嘧啶(5mC)、5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)、5-醛基胞嘧啶(5fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC)等多种表观基因组修饰。本实验室开发了多个单碱基、单细胞水平上表观基因组的组学检测技术,未来将应用于单细胞测序和临床研究,以期鉴定疾病的生物标志物。此外,我们也关注染色质可及性的组学检测技术。



1. Liu J, Li K, Cai J, Zhang M, Zhang X, Xiong X, Meng H, Xu X, Huang Z, Peng J. Fan J*, YI C*. Landscape and Regulation of m6A and m6Am Methylome across Human and Mouse Tissues. Mol Cell. 2020; 77:426-440.
2. Song J, Zhuang Y, Zhu C, Meng H, Lu B, Xie B, Peng J, Li M*, Yi C*. Differential roles of human PUS10 in miRNA processing and tRNA pseudouridylation. Nat Chem Biol. 2020; 16: 160-169. 
3. Sun H, Zhang M, Li K, Bai D, Yi C*. Cap-specific, terminal N(6)-methylation by a mammalian m(6)Am methyltransferase. Cell Res. 2019; 29: 80-82.
4. Shu X, Liu M, Lu Z, Zhu C, Meng H, Huang S, Zhang X, Yi C*. Genome-wide mapping reveals that deoxyuridine is enriched in the human centromeric DNA. Nat. Chem. Biol. 2018; 14: 680-687.
5. Li X, Xiong X, Zhang M, Wang K, Chen Y, Zhou J, Mao Y, Lv J, Yi D, Chen X, Wang C, Qian S, Yi C*. Base-Resolution Mapping Reveals Distinct m1A Methylome in Nuclear- and Mitochondrial-Encoded Transcripts. Molecular Cell, 2017; 68: 993-1005.
6. Zhu C, Gao Y, Guo H, Xia B, Song J, Wu X, Zeng H, Kee K, Tang F*, Yi C*. Single-Cell 5-Formylcytosine Landscapes of Mammalian Early Embryos and ESCs at Single-Base Resolution. Cell Stem Cell, 2017; 20: 720-731.
7. Zhang Y, Liu L, Guo S, Song J, Zhu C, Yue Z, Wei W*, Yi C*. Deciphering TAL effectors for 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine recognition. Nat. Commun., 2017; 8: 901.
8. Li X, Xiong X, Yi C*. Epitranscriptome sequencing technologies: decoding RNA modifications. Nat. Methods, 2016; 14: 23-31.
9. Li X, Xiong X, Wang K, Wang L, Shu X, Ma S, Yi C*. Transcriptome-wide mapping reveals reversible and dynamic N1-methyladenosine methylome. Nat. Chem. Biol., 2016; 12: 311-316.
10. Li X, Zhu P, Ma S, Song J, Bai J, Sun F, Yi C*. Chemical pulldown reveals dynamic pseudouridylation of the mammalian transcriptome. Nat. Chem. Biol., 2015; 11: 592-597.
11. Xia B, Han D, Lu X, Sun Z, Zhou A, Yin Q, Zeng H, Liu M, Jiang X, Xie W, He C*, Yi C*. Bisulfite-free, base-resolution analysis of 5-formylcytosine at the genome scale. Nat. Methods, 2015; 12: 1047-1050.


实验室致力于RNA/DNA修饰的新生物学通路、新功能和新机制研究。我们综合运用包括化学生物学、表观遗传学、基因编辑、单细胞组学和基因组学等多学科手段,尤其关注RNA生物学在人类疾病诊断与治疗当中的应用。


实验室电话8610-62752895


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