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杜鹏

邮  箱: pengdu@pku.edu.cn

职  称:研究员

办公室电话:62750759

办公室地址:北京市海淀区颐和园路5号,北京大学,吕志和楼,100871

实验室地址:北京市海淀区颐和园路5号,北京大学,吕志和楼,100871

个人主页:http://https://vip.kuaimen.bid/extdomains/scholar.google.com/citations?user=4_eJyQMAAAAJ&hl=en

  • 个人简介
  • 科研领域
  • 代表性论文
  • 实验室简介

个人介绍:

杜鹏博士,2012年于北京大学获得博士学位,后进入哈佛大学医学院/波士顿儿童医院从事博士后研究。2018年9月起任北京大学生命科学学院和北京大学-清华大学生命科学联合中心研究员。杜鹏博士长期从事鉴定未知RNA调控通路,并研究其在胚胎干细胞和早期胚胎发育中功能的相关研究,在Cell,Nature, Cell stem Cell, Molecular Cell, PNAS,PLoS Pathogen等国际学术期刊上发表多篇论文。

教育经历:

2006.09-2012.07 博士,北京大学生命科学学院;
2002.09-2006.07 学士,山东师范大学生命科学学院

荣誉奖励:

中国干细胞协会卓越青年研究员奖,2021
勃林格殷格翰青年研究员奖,2021
东宝奖教金,2021;
拜耳学者奖, 2019;
億方学者, 2019;
哈佛华人生命科学研究奖,2016;
北京大学优秀毕业论文奖,2012

工作经历:

2018.09-至今 研究员 北京大学生命科学学院;
2018.09-至今 研究员 北大清华生命科学联合中心;
2012.09-2018.09 博士后 哈佛大学医学院/波士顿儿童医院;
2010.09-2012.04 访问学者 加州大学河滨分校

执教课程:

生命科学原理与前沿(本),秋季
细胞遗传发育前沿(本),秋季
遗传学基础(研、CLS),秋季
高级遗传学(研、CLS),秋季
发育生物学(研、PTN),春季
细胞衰老与死亡(研),春季
      本课题组的研究集中在RNA生物学与干细胞生物学。我们综合运用传统的生物化学,分子生物学,结合高通量测序,基因组学,生物信息学等手段来分析和鉴定未知的RNA调控通路,研究相关RNA调控通路在胚胎干细胞的分化命运决定和早期胚胎发育中的功能。同时,我们致力于在动物细胞中重组植物或微生物中特异的RNA调控通路,并分析其潜在的对于基础科学研究和转化医学研究中的价值。
主要研究课题:
1, 鉴定未知的RNA调控元件及分析其对应的调控机制。
2, 研究RNA调控如何决定胚胎干细胞全能性及多能性状态的转化及分化命运。
3, 哺乳动物细胞中植物或微生物RNA调控通路的重建及其潜在应用。
1. Ye Qi#, Li Ding#, Siwen Zhang, Shengze Yao, Jennie Ong, Yi Li, Hong Wu, and Peng Du* (2022). A plant immune protein enables broad antitumor response by rescuing microRNA deficiency. Cell, in press. (*Corresponding author)
2. Yanxin Li#, Zhongqiu Li#, Min Yang#, Feiyang Wang#, Yuehong Zhang#, Rong Li, Qian Li, Yunxia Gong, Binhong Wang, Baoguang Fan, Chunyue Wang, Lei Chen, Hong Li, Jennie Ong, Zhaoqian Teng, Lei Jin*, Yan-Ling Wang*, Peng Du* and Jianwei Jiao* (2022). Decoding the temporal and regional specification of microglia in the developing human brain. Cell Stem Cell, 29: 620-634. (*Corresponding author)
3. Hui Shen#, Min Yang#, Shiyu Li#, Jing Zhang, Bing Peng, Chunhui Wang, Zai Chang, Jennie Ong, and Peng Du* (2021). Mouse totipotent stem cells captured through spliceosomal repression. Cell.184:2843-2859.(*Corresponding author)
4. Yingzi Cui#, Xuehui Lyu#, Li Ding, Lan Ke, Dechang Yang, Mehdi Pirouz, Ye Qi, Jennie Ong, Ge Gao, Peng Du*, and Richard I. Gregory* (2021). Global miRNA dosage control of embryonic germ layer specification. Nature.593:602-606. (*Corresponding author)
5. Choe J, Lin S, Zhang W, Liu Q, Wang L, Ramirez-Moya J, Du P, Kim W, Tang S, Sliz P, Santisteban P, George RE, Richards WG, Wong KK, Locker N, Slack FJ, Gregory RI (2018). mRNA circularization by METTL3-eIF3h enhances translation and promotes oncogenesis. Nature. 561:556-560.
6. Park HH, Triboulet R, Bentler M, Guda S, Du P, Xu H, Gregory RI, Brendel C, Williams DA (2018). DROSHA Knockout Leads to Enhancement of Viral Titers for Vectors Encoding miRNA-Adapted shRNAs. Mollecular Therapy. 12:591-599.
7. Du P, Pirouz M, Choi J, Huebner AJ, Clement K, Meissner A, Hochedlinger K, and Gregory RI (2018). An Intermediate Pluripotent State Controlled by microRNAs is Required for the Naïve to Primed Stem Cell Transition. Cell Stem Cell. 22:851-864.
8. Pirouz M, Du P, Munafò M, Gregory RI (2016). Dis3l2-Mediated Decay Is a Quality Control Pathway for Noncoding RNAs. Cell Reports. 16:1861-73.
9. Lin S, Choe J, Du P, Triboulet R and Gregory RI (2016). METTL3 promotes translation in human cancer cells. Molecular Cell. 62:335-45.
10. Du P, Wang L, Sliz P, Gregory RI (2015). A Biogenesis Step Upstream of Microprocessor Controls miR-17∼92 Expression. Cell. 162:885-99.
11. Guda S, Brendel C, Renella R, Du P, Bauer DE, Canver MC, Grenier JK, Grimson AW, Kamran SC, Thornton J, de Boer H, Root DE, Milsom MD, Orkin SH, Gregory RI, Williams DA (2015). miRNA-embedded shRNAs for Lineage-specific BCL11A Knockdown and Hemoglobin F Induction. Molecular Therapy 10.1038
12. Thornton JE, Du P, Jing L, Sjekloca L, Lin S, Grossi E, Sliz P, Zon LI, Gregory RI (2014). Selective microRNA uridylation by Zcchc6 (TUT7) and Zcchc11 (TUT4). Nucleic Acids Res. 42:11777-91
13. Cao MJ#, Du P#, Wang XB, Li Y, Ding SW (2014). Virus infection triggers widespread silencing of host genes by a distinct class of endogenous siRNAs in Arabidopsis. PNAS. 111:14613-8. (# Co-first auther).
14. Du P#, Wu JG#, Zhang J, Zhao SQ, Zheng H, Gao G, Wei L, Li Y. (2011) Viral Infection Induces Expression of Novel Phased MicroRNAs from Conserved Cellular MicroRNA Precursors. PLoS Pathogens. 7:e1002176 (# Co-first author).

我们的研究集中于干细胞与肿瘤中的RNA生物学。

在干细胞研究方面,实验室最近的研究通过对于剪接体(splicesoeme)的抑制,实现了迄今为止分化潜能最高的细胞---全能性胚胎干细胞, 的捕获和培养 (Cell, 2021),在此基础上,我们将进一步对该培养条件进行优化,以期最终获得不同物种来源的全能性干细胞的体外培养。继而全能性干细胞为起始细胞,探索其分化到不同种类的功能细胞及类器官的分化体系,从而最终获得可应用于再生医学的高质量细胞和器官。

实验室也利用基础的生物化学和分子生物学的手段鉴定和发现新型的RNA调控通路。实验室最新的研究发现了一种通过基因转录起始事件介导的的微小RNA(microRNA)的整体剂量调控机制,以及该机制在早期胚胎发育三胚层命运决定中的关键作用 (Nature, 2021)。未来我们继续致力于发现和鉴定决定细胞分化命运及肿瘤发生过程中的核心RNA介导的调控通路,并解析其生理学功能。

同时,我们在尝试利用已知相关知识进行跨物种应用的相关研究。比如我们最近的研究利用一直植物特异免疫反应通路蛋白RDR,实现了对于肿瘤细胞的广谱抑制。


实验室电话010-62750759

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